De Ju 87R had een B-serie airframe met een extra olietank en extra brandstofleidingen om het gebruik van twee 300 liter drop tanks mogelijk te maken. Dit verhoogde de brandstofcapaciteit tot 1.080 liter. Om overbelasting te voorkomen, was de bommenlast vaak beperkt tot een enkele bom van 250 kg als het vliegtuig volledig met brandstof was beladen.
De totale productie bedroeg 972 Ju 87R (105 R-1, 472 R-2, 144 R-4), allemaal gebouwd door Weserflug. De laatste Ju 87R rolde in oktober 1941 van de band.